Doktor habilitowany, p.o. zastępcy dyrektora Instytutu Biologii Ssaków Polskiej Akademii Nauk w Białowieży. W 1989 r. ukończył studia na Wydziale Biologii, Geografii i Oceanologii Uniwersytetu Gdańskiego. Dziesięć lat później uzyskał tytuł doktora na Wydziale Biologii Uniwersytetu Warszawskiego, a 2010 r. stopień doktora habilitowanego w Instytucie i Muzeum Zoologii PAN. Od 2003 r. jest redaktorem czasopisma naukowego „Acta Theriologica”.
Główną dziedzinę zainteresowań Krzysztofa Schmidta stanowią problemy ekologii i ochrona dzikich kotów. Wśród jego publikacji znajduje się m.in. „Słownik kotów świata” (2001). Badał populację rysia eurazjatyckiego i jej wpływ na ssaki kopytne, takie jak sarny i jelenie, w Puszczy Białowieskiej. Był też uczestnikiem projektów, w których analizowano ekologię wilka w północno-wschodniej Polsce oraz rysi w Norwegii. Razem z japońskimi naukowcami badał koty z wyspy Iriomote. Opisał je razem z Nakanishi Nozomi w popularnonaukowej książce „Iriomote – wyspa dzikich kotów” (2008).
Krzysztof Schmidt jest członkiem Rady Naukowej Zakładu Badania Ssaków PAN (od 1999 r., w latach 2003–04 pełnił funkcję jej sekretarza), Rady Konsultacyjno-Naukowej Parku Dzikich Zwierząt w Kadzidłowie (od 2005 r.) i Lokalnej Komisji ds. Doświadczeń na Zwierzętach w Białymstoku (od 2010 r.).